MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 8316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	TATT	2	8	315869	315876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021738	T	6	6	315957	315962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021738	TAT	2	6	316000	316005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021738	TGA	2	6	316991	316996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021738	ATC	2	6	317086	317091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_021738	AGC	2	6	317093	317098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021738	TTA	2	6	317381	317386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021738	T	6	6	320078	320083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021738	T	6	6	320113	320118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021738	AAT	2	6	320125	320130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021738	A	7	7	320147	320153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021738	TCAT	2	8	320197	320204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_021738	AAC	2	6	320600	320605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_021738	TTA	2	6	320630	320635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_021738	AGA	2	6	320644	320649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021738	CAA	2	6	320714	320719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021738	GGT	2	6	320732	320737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021738	A	6	6	320779	320784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021738	TGA	2	6	320791	320796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021738	TGT	2	6	320812	320817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021738	CAG	2	6	320897	320902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_021738	TCA	2	6	320928	320933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_021738	TAT	2	6	320993	320998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021738	AAGA	2	8	321033	321040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021738	AC	3	6	321072	321077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_021738	CAA	2	6	321144	321149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021738	TGC	2	6	321215	321220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021738	TTTA	2	8	321339	321346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021738	GAA	2	6	321460	321465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021738	TAT	2	6	321518	321523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021738	GACA	2	8	321635	321642	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_021738	CTTG	2	8	321858	321865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_021738	GTT	2	6	321871	321876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021738	AC	3	6	321899	321904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_021738	AAAAAT	2	12	321935	321946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021738	TATTTT	2	12	321977	321988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021738	CAAT	2	8	322971	322978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_021738	T	7	7	323824	323830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021738	ATT	2	6	324452	324457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021738	CTA	2	6	324475	324480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_021738	ATTT	2	8	324505	324512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021738	T	7	7	324548	324554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021738	T	7	7	324573	324579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021738	TGA	2	6	326595	326600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021738	CAC	2	6	327568	327573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_021738	TGG	2	6	327581	327586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021738	ATT	2	6	327619	327624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021738	AAT	2	6	327676	327681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021738	ATC	2	6	327686	327691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_021738	TC	3	6	327690	327695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_021738	TAA	2	6	327713	327718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021738	CAT	2	6	327722	327727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_021738	TTA	2	6	327749	327754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021738	TAA	2	6	327770	327775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021738	TATT	2	8	327776	327783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021738	GCA	2	6	327893	327898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021738	TAC	2	6	329005	329010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021738	T	6	6	329089	329094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021738	TAA	2	6	329583	329588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021738	ATT	2	6	329599	329604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021738	AAT	2	6	329631	329636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021738	TAAAA	2	10	330847	330856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021738	T	6	6	330870	330875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021738	AAT	2	6	332344	332349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021738	TA	3	6	332383	332388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021738	ATC	2	6	332411	332416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021738	ATA	2	6	332453	332458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021738	AAT	2	6	332539	332544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021738	ATG	2	6	332594	332599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021738	T	6	6	332605	332610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021738	GTT	2	6	332613	332618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021738	CATTG	2	10	332680	332689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_021738	ATG	2	6	332717	332722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021738	CAAT	2	8	332727	332734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_021738	ATAA	2	8	332744	332751	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021738	T	6	6	332794	332799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021738	ATG	2	6	332809	332814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021738	CAAT	2	8	332819	332826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_021738	ATAA	2	8	332836	332843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021738	T	6	6	332886	332891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021738	CCG	2	6	332917	332922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021738	TAA	2	6	332934	332939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021738	ATC	2	6	332944	332949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_021738	GTA	2	6	332967	332972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021738	CATA	2	8	332978	332985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_021738	A	6	6	333025	333030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021738	GTC	2	6	333048	333053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021738	CAA	2	6	333080	333085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_021738	AGCA	2	8	333108	333115	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_021738	CAA	2	6	333122	333127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021738	A	7	7	333148	333154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021738	CTA	2	6	336976	336981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021738	ATT	2	6	337065	337070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_021738	TTA	2	6	337075	337080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021738	TCT	2	6	337101	337106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021738	A	6	6	337142	337147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021738	T	6	6	337152	337157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021738	CAAA	2	8	337206	337213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_021738	A	6	6	339245	339250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021738	AAT	2	6	339803	339808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021738	A	6	6	339813	339818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021738	A	6	6	341472	341477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021738	TAAA	2	8	342355	342362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021738	AAAAG	2	10	342368	342377	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021738	ATA	2	6	343242	343247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021738	T	7	7	343267	343273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021738	TA	3	6	343306	343311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021738	A	7	7	343311	343317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021738	CGGA	2	8	343346	343353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_021738	TACAA	2	10	343357	343366	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1111	NC_021738	TAAT	2	8	343370	343377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021738	CTT	2	6	345133	345138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021738	ACA	2	6	345146	345151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_021738	TCT	2	6	345157	345162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021738	A	7	7	345179	345185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021738	AT	3	6	347435	347440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021738	A	6	6	347502	347507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021738	T	7	7	347567	347573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021738	AAT	2	6	348442	348447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021738	GCA	2	6	348465	348470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021738	ACTT	2	8	348492	348499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_021738	TAA	2	6	348527	348532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021738	CAGGT	2	10	348555	348564	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1124	NC_021738	TA	3	6	351394	351399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021738	CT	3	6	351461	351466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_021738	A	6	6	351469	351474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021738	TAA	2	6	352761	352766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021738	GAA	2	6	352911	352916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021738	CTTT	2	8	352936	352943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_021738	AAAG	2	8	352967	352974	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021738	A	8	8	352981	352988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021738	T	7	7	355072	355078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021738	T	7	7	355096	355102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021738	T	7	7	356619	356625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021738	TAA	2	6	356634	356639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021738	TAAAA	2	10	358291	358300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_021738	CTG	2	6	358484	358489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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